医院脊髓损伤治疗科成立于年7月，之前为神经外科一个病区，是全军唯一一所由神经外科医师专门治疗及研究脊髓损伤及其疾病的中心，拥有一支受过国外专家培训、熟练掌握国际通用的脊髓损伤（ASIA）评价系统、具有丰富经验的临床医师及康复师队伍，科室编制床位99张，其中含16张重症监护病床，具有适宜脊髓损伤病人起居和洗浴的病房、设备完善的上肢训练室、下肢训练室、生活能力训练室、理疗室、中药泡浴室、全国最大的水疗室、轮椅橄榄球训练场，病房内外有专为脊髓损伤患者设计的轮椅通道。
科室具有原始创新的手术及康复训练与评定方法——“昆明步行分级（KLS）”已在国际上推广及应用。科室集“手术—细胞培养与移植—截瘫康复—脊髓损伤伤残评定—就业指导”为一体。拥有6名客座教授，其中2名中科院院士、2名美国著名脊髓损伤基础研究专家。已形成了一个国际间合作的脊髓损伤临床治疗与科研的团队，在国内外享有一定的知名度。
科室先后承担全军及云南省重大项目“截瘫康复治疗新技术”、“急性脊柱脊髓损伤的早期治疗”、“脐带血干细胞移植治疗脊髓损伤”、“创伤急救搬运毯的研制与应用”等九项课题。开展的“人胚胎雪旺氏细胞、嗅鞘细胞、脐带血干细胞髓内移植治疗脊髓损伤”、自主研发了“急性脊柱脊髓损伤早期脊柱内固定、髓内外减压联合手术”的创新手术方法，配合术后早期综合康复训练，获得了较好的疗效，使全瘫患者脊髓功能得到1级以上恢复比例由11%提高到45.4%，达到了世界先进水平。
在国际上首创“脊髓损伤10级评估体系”和阶梯康复训练新方法，显著提高了脊髓损伤康复效果；同时开展了脊柱脊髓先天性疾病手术：如寰枕畸形（Chiari畸形）伴脊髓空洞、脊髓纵裂、脊膜脊髓膨出、脊髓栓系综合征等；髓内外肿瘤切除术、脊柱肿瘤、结核、脊柱退行性变（如椎间盘突出、膨出、椎体滑脱、椎管狭窄）等手术。特别是对寰枕畸形（Chiari畸形）伴脊髓空洞患者在行枕骨大孔区充分减压、脊髓空洞“T”管引流的同时，行枕颈融合或上颈椎内固定术，其疗效优于单纯枕骨大孔区减压术。吸引来自全国各地的患者，年完成各类手术达-台次，手术具有精、准、快、出血少、疗效优于传统治疗方法等特点，多采用非X光定位徒手脊柱内固定技术。
科室多次承办国际学术会议，为军地、医院及国外（如美国、以色列、荷南、挪威、伊朗）等专家表演示范手术。中心研制的新型担架——“创伤急救搬运毯”，具有携带方便、操作简单、固定牢靠、连同担架可做X片、CT、MRI、B超特殊检查等特点，能一人背、二人抬，在海、陆、空、丛林、陡坡、隧道、雪地、沙漠、高原、高热、高寒等各种复杂条件下搬运伤员，使脊髓二次损伤的发生率由国际上的22.5%降至0。
科室获国家新型实用专利及发明专利6项，获国家科技进步二等奖、云南省科技进步一等奖、军队医疗成果二等奖各一项、云南省科技进步三等奖两项。
科室多名人员先后参加5.12汶川、彝良、宁蒗等抗震救灾，为年“全国抗震救灾英雄集体”成员之一；荣立军区联勤部集体三等功一次，两位学科带头人获“十一五”科技先进个人；科室特别重视扶残助残工作，年科室被国务院评为“全国扶残助残先进集体”。
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